WissKI дозволяє сформувати віртуальне дослідницьке середовище (virtual research environment, VRE) для управління даними на засадах Linked Data.

Підготовка концептуальної моделі до машиночитної реалізації здійснюється за допомогою спеціального програмного забезпечення — редакторів онтологій. Нині один із найпопулярніших серед них — Protégé.